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En este artículo se pretende mostrar el fundamento teórico en el cual tiene soporte la investigación inter y transdisciplinaria, no se quiere pasar por alto las dificultades que encuentra este tipo de investigación. Se presenta también la convicción de que los cambios ocurridos en el conocimiento del siglo XX, especialmente los relacionados con la física cuántica, permitieron el desplazamiento del paradigma cartesiano-newtoniano y la posibilidad de ver el desarrollo del conocimiento en nuevas formas de racionalidad, donde la investigación inter y transdisciplinaria marca el futuro del trabajo investigativo y del quehacer científico.