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Con base en experiencias docentes sobre las que se viene reflexionando en las instituciones universitarias que tratan con los animales como objetos de estudio e intervención profesional, se plantea la existencia de tres problemas: la separación de los aspectos éticos y metodológicos en la formación profesional, la creencia de que por trabajar con animales se los sabe tratar y el uso simultáneo de los mismos animales para diferentes actividades. Se analizan brevemente algunas sugerencias para organizar alternativas que ayuden a superar estos problemas al interior de las instituciones universitarias que tienen programas centrados en el manejo y uso de animales, tanto para docencia como para investigación.